Викликається грибами родів Cladosporium Link., Alternana Nees, Nigrospora Zimm. та Ін. Воно характеризується утворенням чорного або темно-оливкового нальоту, частіше у верхній частині качанів. Початок ураження звичайно спостерігається у місцях пошкодження насіння оболонки зернівок. Для розвитку темного пліснявіння найбільш сприятлива температура вище 12°С.