Виявляють на тютюні і махорці у парниках майже скрізь. Вона характеризується почорнінням основи стебла молодих рослин. Прогресуючи, хвороба часто охоплює значну частину стебла, внаслідок чого воно тоншає, і рослина гине. Спалахує захворювання частіше вогнищами, Іноді може охоплювати всі парникові посіви. Хворобу викликають гриби Rhizoctonia solani Kuehn. і Pythium debaryanum Hesse. Перший розвивається при температурі 20, а другий — 16-19 °С. На стеблинках розсади, ураженої Rh.solani, виявляють бурі багатоклітинні гіфи 7-10 мкм завтовшки, що гілкуються під прямим кутом. Гриб зимує у грунті склероціями. При ураженні P.debaryanum у вологих умовах утворюється білий повстяний наліт зооспорангієносців із зооспорангіями. Зооспорангії слабко гілкуються й незначно відрізняються від грибниці. Вони округлі, 15-25 мкм у діаметрі, здебільшого поодинокі, інколи мають вигляд ланцюжка. Проростають на місці появи бічних пухирців з утворенням зооспор. У рослинах гриб утворює ооспори, з якими і зимує.

При недостатньому контролі під час вибирання розсади хвороба може бути занесена в поле і зумовити випадання рослин.

Чорна ніжка сильно проявляється при високій вологості (у погано провітрюваних парниках), за однобічного підживлення азотними добривами і загущених посівах.